ارسل ملاحظاتك

ارسل ملاحظاتك لنا







Serological and Molecular Detection of Alfalfa Mosaic Virus in the Major Potato Growing Areas of Saudi Arabia

العنوان بلغة أخرى: الكشف السيرولوجي والجزيئي عن فيروس تبرقش البرسيم في المناطق الرئيسية لزراعة البطاطس في المملكة العربية السعودية
المصدر: المجلة العلمية لجامعة الملك فيصل - العلوم الأساسية والتطبيقية
الناشر: جامعة الملك فيصل
المؤلف الرئيسي: الهديب، خالد عبدالله (مؤلف)
المجلد/العدد: مج20, ع1
محكمة: نعم
الدولة: السعودية
التاريخ الميلادي: 2019
الشهر: يونيو
الصفحات: 73 - 82
ISSN: 1658-0311
رقم MD: 1056538
نوع المحتوى: بحوث ومقالات
اللغة: الإنجليزية
قواعد المعلومات: science
مواضيع:
كلمات المؤلف المفتاحية:
الإليزا | البطاطس | تفاعل البلمرة المتسلسل | تهجين الحمض النووي | الفاموفيرس | فيروس تبرقش البرسيم | Alfamovirus | AMV | Dot Blot Hybridization | ELISA | PCR | Potato
رابط المحتوى:
صورة الغلاف QR قانون
حفظ في:
المستخلص: تعد البطاطس من أهم محاصيل الخضر في المملكة العربية السعودية. فيروس تبرقش البرسيم من بين أكثر الفيروسات انتشارا في البطاطس. تم إجراء عدة زيارات ميدانية في مناطق زراعة البطاطس الرئيسية (الرياض - القصيم - حائل حرض) خلال فصلى الربيع والخريف من موسم زراعة البطاطس في عامي 2015 و 2016. تم الكشف عن وجود الفيروس في العينات باستخدام اختبارات الإليزا. تم عمل تفاعل النسخ العكسي وتفاعل البلمرة العكسي للتحقق من حساسية اختبار إليزا، بينما تم عمل طريقة التهجين كبديل لاختبار الإليزا. وقد لوحظت أعلى نسبة للعدوى بالفيروس بنسبة 18.6% في حقول القصيم، تليها الرياض بنسبة 15.2%، في حين سجلت أدنى معدلات الإصابة في كل من حقول حرض وحائل 8.3 و10.4% على التوالي. تم تحديد التتابعات النيكليوتيدة لسبع عزلات من فيروس تبرقش البرسيم التي تم الحصول عليها في هذه الدراسة، والتي تمت مقارنتها بالتتابعات المتاحة في قاعدة بيانات بنك الجينات. وأكدت التحليلات انخفاض التباين بين سلالات فيروس تبرقش البرسيم في هذه الدراسة، مما يعني أن جميع العزلات هذا الفيروس قد تكون نشأت من المصدر نفسه. ونظرا لارتفاع معدل الإصابة بفيروس تبرقش البرسيم، فقد تتأثر المحاصيل الاقتصادية الأخرى القابلة للإصابة بهذا الفيروس نتيجة ارتفاع نسبة الإصابة في محصول البطاطس. وهذا يتطلب فحصا دقيقا لدرنات البطاطس المستخدمة كتقاوي لمنع انتشار الفيروس في المملكة العربية السعودية. وأشارت النتائج التي تم الحصول عليها إلى أن طريقة التهجين للحمض النووي واختبار الإليزا هي تقنيات مناسبة في الكشف الروتيني لفيروس تبرقش البرسيم في عدد كبير من العينات، في حين أن تفاعل النسخ العكسي - تفاعل البلمرة المتسلسل هو أكثر حساسية وأساسي للتوصيف الجزيئي لفيروس تبرقش البرسيم.

Potato (Solanum tuberosum L.) is considered one of the most important and potential vegetable crops in Saudi Arabia. Alfalfa mosaic virus (AMV), genus Alfamovirus, family Bromoviridae is among the broad spread viruses in potato. Several potato fields in four major growing areas (Riyadh,Qassim, Hail and Hard) were inspected for the presence of AMV, during spring and fall growing seasons of potato in of 2015 and 2016. The presence of AMV was detected in potato leaf samples using ELISA. RT-PCR was conducted to validate the sensitivity of ELISA test and dot blot hybridization was established as alternative method of ELISA. The highest occurrence of AMV was observed as 18.6% of yellow leaves in Qassim followed by Riyadh with 15.2% while, the lowest infection rates were recorded in Hard and Hail, 8.3 and 10.4%, respectively. The sequences of seven isolates of AMV obtained in this study were determined and the sequences were aligned with the other sequences available in the GeneBank database. Analyses confirmed the low variability among AMV isolated in this study, which means that all AMV isolates may originate from the same source. Due to high incidence of AMV, other economic susceptible crops may become affected by high incidence of this virus in potato crops. This requires accurate indexing of imported potato seed tubers to prevent further spread of the virus in Saudi Arabia. The obtained results indicated that the hybridization and ELISA are suitable techniques in the routine detection of AMV in a large number of samples while RT-PCR is more sensitive and essential for molecular characterization of AMV.

ISSN: 1658-0311