| المستخلص: |
خلفية: سرطان المعدة هو السبب الرئيسي الثالث للسرطان في جميع أنحاء العالم على الرغم من أن تقنيات البيولوجيا الجزيئية على سبيل المثال، تحديد نمط التعبير الجيني، تسلسل الجيل التالي قد حددت علامات تنبؤية، إلا أن لا يمكن الاعتماد عليها. بالتالي فإن فهم الآلية الجزيئية الكامنة خلف المرض أمر أساسي لتحديد المؤشرات الحيوية لتحسين معدلات النجاة من هذا المرض. مع التقنيات المتطورة الجديدة، مثل المعلوماتية الحيوية وقواعد البيانات المتاحة للجمهور أصبح الأن من الأسهل والأكثر موثوقية إجراء تحليل على أعداد هائلة من المرضى واكتشاف الجينات المعبر عنها بشكل مختلف. في الدراسات السابقة، تم اكتشاف أن الحمض النووي الريبي الطويل غير المشفر يمكن استخدامه كمؤشر حيوي، والتي يعتقد أنها جزيئات مرشحة لتشخيص المرض الغير الغزوي من سرطان المعدة. الهدف: نحن نهدف إلى مقارنة تسلسلات الحمض النووي الريبي الغير مشفر لمرضى سرطان المعدة مع تسلسل الأفراد الأصحاء وتحديد الأحماض النووية المختلقة بينهما ثم المضي بتسلسل حمض نووي ريبي واحد فقط وخلق تفاعلات لمعرفة دوره التنظيمي على الجينات والمسارات المختلفة التي لها علاقة بسرطان المعدة. الطريقة: لقد تم تحليل 407 حالة (375 مريض و32 أشخاص أصحاء) تم أخذها من موقع الداتا الجينية العامة باستخدام البروتوكول العام وعبر هذا الرابط. (http://bioconductor.org/packages/devel/bioe/vignetles/GDCRNATools/inst/doc/GDCRNATools.html) قد تم تقسيم التحليل إلى 4 أقسام رئيسية على النحو التالي: التنظيم والتعبير الجيني التفاضلي، التصور الجيني التفاضلي والأحماض المعبر عنه، إنشاء شبكة الأحماض الريبوزية الداخلية التنافسية مما نتج عنه تحليل المسارات الداخلية المتعلقة بهذا المرض. النتائج: بعد الانتهاء من التحليل على 407 حالة، تم العثور على 20933 جين يتم التعبير عنهم بشكل مختلف لدى المرضى منهم 2100 جينات ترميز البروتين و170 تسلسلات الحمض النووي الريبية والبقية كانوا جينات كاذبة وما إلى ذلك. 120 من التسلسلات النووية الريبية كان التعبير عنها أعلى في المرضى بينما البقية كانت أقل ولمزيد من الدراسة وتم اختيار تلك المهمة إحصائيا. فقط 5 من الأحماض النووية وجدت ذات تأثير إحصائي كبير على البقاء على قيد الحياة وهم AL353622.1و AL365181.3و LINC00884و TNFRSF14-AS1 تم التعبير عنهم بشكل اعلى في مرضى المراحل البدائية بالإضافة إلى أن تم التعبير عنه بشكل أعلى في مرضى المراحل المتأخرة. وقد كشق تحليل الانتركتوم أن الأخير يتفاعل مع AC125807.2 9 من الجينات المشفرة للبروتين وهي .CCNB2و PRKDCو BUBIBو CDC25Bو MCM4و E2F2و CDK6و PLK1و PRKDC تحليل المسارات أوضح أن مسار حياة الخلية هو أكثر مسار متأثر لدى مرضى سرطان المعدة وأن في الأغلب أن الأحماض الريبية غير المشفرة تؤدي دورها عبر الجينات المشفرة للبروتين. بالإضافة أن يلعب دورا مهما جدا في امراضية سرطان المعدة عبر التفاعل مع عدد من الجينات المشفرة AC125807.2 للبروتين. الخلاصة:TNERSF14-AS1, LINC00884, AL365181.3, AL353622.1, AC125807 هم مرشحون محتملون كمؤشرات حيوية لسرطان المعدة و AC125807 قد يلعب دورا مهما في امراضية سرطان المعدة عبر التأثير التنظيمي على 9 جينات ترميز بروتيني فعالة ومهمة في مسار دورة الخلية.
|
