ارسل ملاحظاتك

ارسل ملاحظاتك لنا







الرئيسية > In Silico Structural Analysis...>الوصف

In Silico Structural Analysis of the Cell Division Protein, FtsZ: Screening Natural Products for Inhibitors

المصدر: مجلة التربية والعلم
الناشر: جامعة الموصل - كلية التربية
المؤلف الرئيسي: Al-Khayyat, Mohammed Zaghlool (Author)
مؤلفين آخرين: Al-Refaie, Yousra Abdul-Razaq (Co-Author) , Al-Dabbagh, Ammar Ghanem (Co-Author)
المجلد/العدد: مج28, ع1
محكمة: نعم
الدولة: العراق
التاريخ الميلادي: 2019
الصفحات: 17 - 36
DOI: 10.33899/edusj.2019.160910
ISSN: 1812-125X
رقم MD: 1201482
نوع المحتوى: بحوث ومقالات
اللغة: الإنجليزية
قواعد المعلومات: EduSearch
مواضيع:
الاحماض الأمينية | البروتينات | التحليل الكيميائي | المركبات الكيميائية | المعلومات الحيوية
كلمات المؤلف المفتاحية:
أوتودوك 4.2.6 | الدونيانول | النمذجة المنتاظرة | المعلوماتية الحيوية | AutoDock 4.2.6 | Dunnianol | Homology Modeling | Bioinformatics
رابط المحتوى:

الناشر لهذه المادة لم يسمح بإتاحتها.
صورة الغلاف QR قانون
حفظ في:
المستخلص: البروتين FtsZ هو مناظر للتوبيلين إذ يشكل حلقة Z لجذب البروتينات الأخرى في عملية الانقسام الخلوي من خلال فعالية GTPase الخاصة به. تم الحصول على تسلسل الأحماض الأمينية للبروتين من قاعدة البيانات Uniport واستخدم التسلسل في تحديد التركيب الأولي والثانوي من خلال برامجيات المعلوماتية الحيوية في الشبكة العنكبوتية. بني التركيب الثالثي للبروتين باستخدام طريقة النمذجة المتناظرة بواسطة برنامجي SWISS—MODEL وPHYRE2 والتي أثبتت البرامجيات الخاصة بتقييم نوعية البروتين أن النموذج المبني من قبل SWISS—MODEL أكثر دقة من الآخر ولهذا استخدم في تجارب قياس ألفة الارتباط مع خمس وعشرون مركبا طبيعيا بواسطة برنامج 4.2.6 Auto Dock. بينت النتائج أن مركبات الدونيانول والبربللين والدالبينول والهيدراجينين تمتلك ألفة ارتباط أكبر من البيربين والسانكيورانين. تم تصميم نظائر تركيبية للدونيانول باستخدام برنامج الكيمواوفيس وتبين أن النظائر 2 و4 و6 تمتلك ألفة ارتباط أعلى من المركب الأصلي ولهذا فإن المركبات الطبيعية ونظائرها المستخدمة في هذه الدراسة ممكن أن تستغل كمثبطات محتملة لبروتينات الانقسام الخلوي كهدف جديد في تصميم المضادات الحيوية.

FtsZ is a tubulin homolog in bacteria. It forms a Z-ring to recruit other proteins in the process of cell division through its GTPase activity. Amino acid sequence of FtsZ was obtained from uniprot database and used for the determination of primary and secondary structures by several online tools. Homology modeling was carried out by SWISS-MODEL and PHYRE2. The models were evaluated and quality assessment indicated that the model produced by SWISS-MODEL had better quality than PHYRE2. Therefore, SWISS-MODEL was used in docking twenty five natural products by AutoDock 4.2.6. Dunnianol, pebrellin, dalbinol and hederagenin had docking energy higher than the previously used berberine and sanguinarine. Analogs of Dunnianol were sketched by ChemBioOffice Ultra 11.0 and docked. The analogs 2,4 and 7 had higher docking energy than the original compound. These natural products and the analogs obtained in this study could serve as possible inhibitors of this cell division protein, a new target in the development of new antimicrobials.
ISSN: 1812-125X

عناصر مشابهة


© 2024 المنظومة. جميع الحقوق محفوظة.