ارسل ملاحظاتك

ارسل ملاحظاتك لنا







الرئيسية > الكشف عن معزز محتمل لنمو النبا...>الوصف

الكشف عن معزز محتمل لنمو النبات من خلال تحليل الجينوم الكامل in Silico Bacillus Rhizoplanae CIP111899

العنوان بلغة أخرى: Revealing of Potential Plant Growth-Enhancing Traits through in Silico Genomic Analysis of Bacillus Rhizoplanae CIP111899
المصدر: المجلة العلمية لجامعة الملك فيصل - العلوم الأساسية والتطبيقية
الناشر: جامعة الملك فيصل
المؤلف الرئيسي: القندوز، ضيف (مؤلف)
مؤلفين آخرين: عبدالغني، زيتوني (م. مشارك)
المجلد/العدد: مج24, ع1
محكمة: نعم
الدولة: السعودية
التاريخ الميلادي: 2023
الشهر: يونيو
الصفحات: 34 - 40
ISSN: 1658-0311
رقم MD: 1416647
نوع المحتوى: بحوث ومقالات
اللغة: العربية
قواعد المعلومات: science
مواضيع:
البيولوجيا النباتية | البكتيريا الجذرية | تعزيز النبات | التحليل الجينومي
كلمات المؤلف المفتاحية:
أدوات بيومعلوماتية | الأمن الغذائي | التحليل الجيني | تحمل الإجهاد | تعزيز النبات | الجينات | Bioinformatics Tools | Food Security | Genes | Genome Annotation | Enhancing Plant-Growth | Stress Resistance
رابط المحتوى:
PDF (صورة)     
صورة الغلاف QR قانون
حفظ في:
المستخلص: تهدف هذه الدراسة إلى تحليل الجينوم الكامل لسلالة بكتيرية CIP111899 معزولة من سطح جذور الذرة Zea mays قصد الكشف عن وجود جينات متدخلة في تعزيز نمو النبات وكذا في النشاط المضاد لمسببات الأمراض النباتية التي تكبد الإنسانية خسائر فادحة في الأمن الغذائي، لقد مكنت الدراسة التصنيفية الجينومية من إثبات انتماء السلالة CIP111899 لنوع بكتيري جديد Bacillus rhizoplanae. في خطوة لاحقة إذ تم التحليل الجينومي للسلالة CIP111899 على عدة مستويات وبعدة أدوات معلوماتية كدراسة للجينات المرتبطة بالفئات الوظيفية (COG) من خلال عملية التحليل الجيني (Annotation) وذلك بواسطة خادم RAST ثم التحديد الجيني عن طريق برنامج Prokka ليتم الكشف والتعرف على الجينات المتعلقة بآليات تعزيز نمو النبات والمكافحة البيولوجية ثم البحث عن المجموعات الجينية المسؤولة عن الأيض الثانوي بواسطة أداة التحليل البرمجية antiSMASH التي أظهرت نتائج التحليل الجيني للسلالة CIP111899، حيث تم اكتشاف العديد من الجينات المساهمة في تحمل الإجهادات في جينوم CIP111899 مثل الجينات المشفرة المنتجة لإنزيمات ومركبات مضادة للأكسدة (antioxidants) وإنتاج الجذور الحرة المجهدة للنبات والتي من أهمها على سبيل المثال: سوبر أكسيد ديسمتاز (SOD)، البيروكسيداز (POXs) وكاتلاز (CAT). وكذلك تم العثور على عديد الجينات المتعلقة بصفات تعزيز نمو النبات كإذابة الفسفور اللاعضوي، وإنتاج الهرمونات النباتية والتقاط الحديد، وفي الختام يتضح من خلال مجمل النتائج المحصل عليها أهمية السلالة CIP111899 كمرشح واعد في تعزيز نمو النباتات والمساهمة في الأمن الغذائي.

The objective of this study was to examine the whole genome of the bacterial strain CIP111899, isolated from the root surface of maize (Zea mays), in order to reveal the presence of genes implicated in enhancing plant growth. The genome-based taxonomy revealed that strain CIP111899 belongs to a new species called Bacillus rhizoplanae. In the second step, the genome of CIP111899 was analyzed on multiple levels using various information tools. This involved examining functional categories associated with genes using analytical techniques, namely, annotation using the RAST server, then identifying growth-promoting genes with the Prokka program, and finally detecting groups of genes responsible for secondary metabolism through antiSMASH analysis. The results of the genomic analysis of strain CIP111899 showed the presence of multiple genes that enhance stress tolerance, such as those encoding enzymes and antioxidants (superoxide dismutase, peroxidases, and catalase). Additionally, various plant growthpromoting genes were identified, including those involved in the solubility of inorganic phosphorus, phytohormone production, and iron uptake. In conclusion, strain CIP111899 has shown promise as a potential agent for promoting plant growth and thereby improving food security due to its genetic composition.
ISSN: 1658-0311

عناصر مشابهة


© 2024 المنظومة. جميع الحقوق محفوظة.