العنوان بلغة أخرى: |
Genetic Similarity Among Female, Male, and Bisexual Genotypes of Pistacia Atlantica Desf. Using SSR Technique |
---|---|
المصدر: | المجلة العلمية لجامعة الملك فيصل - العلوم الأساسية والتطبيقية |
الناشر: | جامعة الملك فيصل |
المؤلف الرئيسي: | الحجار، نجوى متعب (مؤلف) |
المؤلف الرئيسي (الإنجليزية): | Alhajjar, Najwa Motaeb |
مؤلفين آخرين: | مزهر، بيان محمد (م. مشارك) |
المجلد/العدد: | مج17, ع2 |
محكمة: | نعم |
الدولة: |
السعودية |
التاريخ الميلادي: |
2016
|
التاريخ الهجري: | 1437 |
الشهر: | ديسمبر |
الصفحات: | 11 - 22 |
ISSN: |
1658-0311 |
رقم MD: | 788052 |
نوع المحتوى: | بحوث ومقالات |
اللغة: | العربية |
قواعد المعلومات: | science |
مواضيع: | |
كلمات المؤلف المفتاحية: |
بطم أطلسي | التشابه الوراثي | تقنية ال SSR | طرز ثنائية الجنس | Bisexual Genotypes | Genetic Similarity | P.atlantica | SSR Technique
|
رابط المحتوى: |
المستخلص: |
تعد كافة أنواع الجنس Pistacia أحادية الجنس ثنائية المسكن، إلا أنه تم تعريف طرز جديدة ثنائية الجنس من البطم الأطلسي (P. atlantica Dest.) ذات تركيب مختلف سواء على مستوى النورة الزهرية أو الأزهار، لذا هدفت الدراسة إلى دراسة التباينات الوراثية بين الطرز ثنائية الجنس بالمقارنة مع الطرز الوراثية المؤنثة والمذكرة باستخدام تقنية الـ SSR (Simple Sequence Repeat). أجرى البحث في الهيئة العامة للبحوث العلمية الزراعية باستخدام 15 زوجاً من بادئات الـ SSR، أظهر منها 14 زوجاً التعددية الشكلية، حيث أعطت 40 أليلاً كان منها 35 أليلاً متعدد شكلياً بنسبة تعددية شكلية (87.5%)، وتراوح عدد الأليلات بين 1- 9 أليلات بمتوسط 2.86 أليلاً لكل موقع. وتراوحت درجة التشابه الوراثي بين 0.3 بين الطرازين ثنائي الجنس PA 37 وPA 52، إلى 0.9 بين الطرازين المذكرين PM1 وPM2. كما كانت درجة التشابه الوراثي بين الطرز المؤنثة والطرز ثنائية الجسن 0.456، وبين الطرز المذكرة والطرز ثنائية الجنس 0.508. قسم التحليل العنقودي اعتماداً على طريقة (Unweighted Pair Group Method using Arithmetic Averages) UPGMA وفقاً لمعامل Jaccard الطرز المدروسة إلى مجموعتين رئيستين ضمت المجموعة الأولى بعض الطرز ثنائية الجنس والطرز المذكرة في حين ضمت المجموعة الثانية ما تبقى من الطرز ثنائية الجنس مع الطرز المؤنثة. ولتقدير كفاءة تقنية الـ SSR تم حساب كل من معدل التغاير المورثي الملاحظ (0.357) Ho (observed heterozygosity)، ومعدل التغاير المورثي المتوقع (expected heterozygosity) (0.672) He، وكذلك ديل الواسم (23.52) MI (Marker Index). وخلصت النتائج إلى دور وكفاءة تقنية الـ SSR في كشف التباينات الوراثية ضمن النوع P. atlantica، ولاسيما أن بعض البادئات أعطت مواقع خاصة للطرز ثنائية الجنس قد يكون لها دور في المستقبل في فهم آلية وراثة الجنس ضمن النوع النباتي المدروس. All Pistacia species are dioecious, male and female flowers are born on different trees. The recent studies identified new bisexual genotypes of P. atlantica with different structure of clusters and flowers in the South of Syria. Hence, our research aimed to assess genetic variation using SSR technique (Simple Sequence Repeat). The research was conducted at the General Commission of Scientific Agricultural Research using 15 SSR primer pairs, 14 of them were able to detect the polymorphism, which revealed 40 putative alleles, 35 of them were polymorphic (87.5%). Allele's number ranged from 1 to 9, with an average 2.86 allele per locus. Genetic similarity among all studied genotypes ranged from (0.3) between the two bisexual genotypes PA37 and PA52, to (0.9) between the two male genotypes PM1 and PM2. Genetic similarity between bisexual and female genotypes was 0.456, while the genetic similarity between bisexual and male genotypes was 0.508. Cluster analysis using UPGMA method (Unweighted Pair Group Method using Arithmetic Averages) according to Jaccard coefficient clustered all genotypes into two main clusters, the first cluster contains some of the bisexual genotypes and male genotypes, while the other cluster includes the remains bisexual genotypes and female genotypes. To estimate the efficacy of SSR technique, each of observed heterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He), and marker index (MI) were calculated, Ho (0.357), He (0.672), MI (23.52). The results showed the importance and the efficacy of SSR technique by revealing the genetic variation among P.atlantica genotypes, since some primer pairs revealed special alleles in bisexual P.atlantica genotypes which may help to understand the mechanism of sexual inheritance within the studied species. |
---|---|
ISSN: |
1658-0311 |