ارسل ملاحظاتك

ارسل ملاحظاتك لنا







الرئيسية > Use BOX-PCR to Study Genetic R...>الوصف

Use BOX-PCR to Study Genetic Relatedness of Some Pseudomonaus aeruginosa Bacterial Isolates From Differnet Clinic and Environmental Sources in Baghdad

العنوان بلغة أخرى: استعمال BOX-PCR لدراسة التقارب الوراثي لبعض من بكتريا Pseudomonaus Aeruginosa المعزولة من مصادر مرضية وبيئية مختلفة في بغداد
المصدر: مجلة كلية التربية الأساسية
الناشر: الجامعة المستنصرية - كلية التربية الأساسية
المؤلف الرئيسي: ناصر، ابتسام حمود (مؤلف)
المجلد/العدد: ع77
محكمة: نعم
الدولة: العراق
التاريخ الميلادي: 2013
الصفحات: 25 - 36
ISSN: 8536-2706
رقم MD: 863636
نوع المحتوى: بحوث ومقالات
اللغة: العربية
قواعد المعلومات: EduSearch
مواضيع:
الهندسة الوراثية | التجارب العملية | البكتيريا الممرضة
رابط المحتوى:

الناشر لهذه المادة لم يسمح بإتاحتها.
صورة الغلاف QR قانون
حفظ في:
المستخلص: تم جمع ست وعشرون عزلة بكتيرية مختلفة من بكتريا Pseudomonas aeuruginosa، كان منها 16 عزلة مرضية أي 62 % من العدد الكلي للعزلات، معزولة من نماذج مختلفة (ادرار، دم ، قشع، جروح، مسحات الأذن والعين و البلعوم) من مستشفى مدينة الطب في بغداد. و كان منها عشرة عزلات بيئية أي 38% من العدد الكلي للعزلات، معزولة من أماكن مختلفة من الماء والتربة في نفس المدينة. شخصت كل العزلات بالاختبارات الباكتريولوجية والبايوكيميائية. تم استخلاص DNA الخام من كل من العزلات المرضية والبيئية. أنجز BOX-PCR باستخدام البادئ BOX1AR، بعدها تم تحليل ناتج التضخيم BOX-PCR باستخدام الترحيل الكهربائي الأفقي بهلام الاكاروز، تم رسم Dendrogram لكل العزلات باستخدام معاملان Jaccard وDice معتمدة - الحزم ، إذ أنجزت الطبعة الوراثية لنسق الحزم باستعمال UPGMA، لدراسة التقارب الوراثي بين العزلات المرضية و البيئية. بينت النتائج أن DNA الخام مناسب لأجراء BOX-PCR ، و وجود تشابه كبير بين نسق الحزم الناتجة عن التضخيم للعزلات المرضية و البيئية نفسها، و التي كانت بحدود 45%- 99% و 61% -100% حسب المعاملان Jaccard و Dice على التوالي. أما التشابه بين هاتين المجموعتين كان بحدود 40%- 55% حسب المعاملان Jaccard و Dice على التوالي. بالرغم من العلاقة الملحوظة بين كل من العزلات المرضية و البيئية، استنتجت هذه الدراسة وجود تباين وراثي بين العزلات المرضية و البيئية لهذة البكتريا الأنتهازية باستخدام تقنية BOX-PCR و باستخدام البادئ BOX1AR.

Totally twenty six different isolates of Pseudomonas aeuruginosa ( P. aeruginosa) were collected ,sixteen clinical isolates ( 62% of total group ) were isolated from different samples ( Urine , blood , sputum , wound , ear , eye and throat swabs ) from Medical city hospital in Baghdad, and ten environmental isolates ( 38% of total group ) were isolates from different places of soil and water in the same city . All isolates were diagnosed by bacteriological and biochemical tests . The crud DNA was extracted from all clinical and environmental isolates . BOX-PCR was achieved using BOX1AR primer . The BOX-PCR products were analyzed by horizontal agarose gel electrophoresis . The dendrogram for all isolates was draw by using band-based Jaccard and Dice coefficients where the fingerprints were generated by banding patterns using un weighted pair-group method with arithmetic average ( UPGMA ) , in order to study the relatedness among the clinical and environmental isolates . The results were showed that the crude DNA was suitable to BOX-PCR , and presence of the high similarity in banding patterns of clinical and environmental isolates it selves , which was about 45%-99% and 61%-100% in Jaccard and Dice coefficients respectively . The similarity between these two groups was about 40% and 55% in Jaccard and Dice coefficients respectively . Although , the marked relatedness among all clinical and environmental isolates , this study was concluded presence of genetic variation between the clinical and environmental isolates of this opportunistic bacterium , by using BOX-PCR technique and BOX 1AR primer .
ISSN: 8536-2706

عناصر مشابهة


© 2024 المنظومة. جميع الحقوق محفوظة.