DNA Barcoding of Migratory Shorebirds in Barr Al Hikman
| العنوان بلغة أخرى: |
باركود الحمض النووري للطيور المهاجرة في بر الحكمان |
|---|---|
| المؤلف الرئيسي: | Al Sudairy, Omar Salim Musallam (Author) |
| مؤلفين آخرين: | Victor, Reginald (Advisor) , Alansari, Aliya Saleh (Advisor) |
| التاريخ الميلادي: |
2017
|
| موقع: | مسقط |
| الصفحات: | 1 - 96 |
| رقم MD: | 948157 |
| نوع المحتوى: | رسائل جامعية |
| اللغة: | الإنجليزية |
| الدرجة العلمية: | رسالة ماجستير |
| الجامعة: | جامعة السلطان قابوس |
| الكلية: | كلية العلوم |
| الدولة: | عمان |
| قواعد المعلومات: | Dissertations |
| مواضيع: | |
| رابط المحتوى: |
عدد مرات التحميل
44
| المستخلص: |
باركود الحمض النووي هي طريقة التصنيف الذي يستخدم تسلسل النيوكليوتيدات لتحديد الأنواع والفصائل. قواعد البيانات مثل GenBank توجد بها تسلسل الجينات لجميع الفصائل تقريبا. قواعد البيانات هذه تعتبر بمثابة مجموعة بيانات مرجعية لمحاذاة العينة غير معروفة وتحديد الهوية. تعد منطقة بر الحكمان، موقعا مثاليا يجذب العديد من الطيور الساحلية المهاجرة والطيور الشتوية التي تستخدم هذا الموقع كنقطة توقف لهجراتها لمسافات طويلة. في هذا المشروع. تم القبض على الطيور باستخدام الشباك الضبابية في بر الحكمان، عمان. تم جمع 202 عينة (80 دم و122 ريشة) من 25 نوعا في نوفمبر 2014 ونوفمبر 2015. تم تحديد الطيور شكليا وإرسال العينات إلى المختبر للتحليل الجزيئي. تم استخراج الحمض النووي وتم إجراء semi-nested PCR لتكاثر منطقة 748 في جين أوكسيديز السيتوكروم واحد (COI). ومن أصل 202 عينة من الدم والريش، تم استخراج 166 عينة بنجاح وتكاثرها وتسلسلها وتحديدها. وأظهرت عينات الدم التي تم تخزينها دون إيثانول أعلى كمية الحمض النووي والجودة تليها عينات الدم مع الإيثانول وأخيرا عينات ريشة مع أدنى تركيز الحمض النووي والنقاء. تم تعديل تسلسل الحمض النووي باستخدام برنامج bioedit وتوزيع العينات في كل نوع إلى مجموعات باستخدام برنامج DNasp. من بين 166 عينة، 160 عينة أظهرت الهوية الجزيئية تتطابق مع الهوية المورفولوجية (96.4%) وستة عينات أظهرت الهوية الجزيئية اختلاف عن الهوية المورفولوجية (3.6%). تم تقسيم هذه العينات إلى مجموعتين، مجموعة "كتبت بالخطأ" بسبب الاختلافات الواضحة بين الأنواع والمجموعة الأخرى التي تم تعريفها بشكل خاطئ بسبب التشابه الكبير بين الأنواع. تم إنشاء شبكة للفصائل التي تحتوي على ثلاثة أو أكثر من مجموعات مختلفة باستخدام برنامج network 5.0. بلغ متوسط المسافة بين K2P لجميع الأنواع 1.8917% (تراوحت بين 1.398 - 3.201%). وقد تبين أن Greater sand plover من عمان وجينات Lesser sand plover المأخوذة من GenBank تبرز أشجار المتداخلة، (فجوة الباركود). أظهرت أن عيناتLesser sand plover Greater sand plover من سلطنة عمان هي أنواع مختلفة، ولكن عينات Lesser sand plover الموجودة في GenBank تم تسميتها بشكل خاطئ. وتم التنبؤ بأنماط الهجرة لبعض الأنواع مثل: Crab plover, Sooty gull, Slender billed gull and Lesser crested tern بسبب 100% تشابه جينات هذه الفصائل مع جينات في GenBank. وهناك حاجة إلى مزيد من تسلسلات الجينات من أجل دراسة التنوع داخل الأنواع والفصائل. سيتم تقديم جميع تسلسل الباركود الحمض النووي لبنك الجينات لتمثيل بيانات قيمة عن الطيور من المنطقة للباحثين المهتمين. |
|---|
عناصر مشابهة
-
Sexing Cycads and DNA Barcoding
بواسطة: Al Moisheer, Agaadir منشور: (2012) -
DNA Barcoding of Birds of Oman Using Cytochrome Oxidase C Subunit 1
بواسطة: Al Breiki, Rufaida Dhuhai Gharib منشور: (2014) -
An Investigation of Two Genes Cdc24 and Dna2 that is Associated with DNA Replication and Repair
بواسطة: Bukhari, Omar منشور: (2011) -
Screen for MRN Separation of Function Mutants That are Specifically Sensitive to Topoisomerase Inhibitors, but no to Other DNA Damaging Agents
بواسطة: Al Harbi, Suliman Ali G. منشور: (2010) -
Biochemical Mechanism of the DNA packaging ATPase from Bacteriophage T4
بواسطة: Al Zahrani, Abd Alrahman S. منشور: (2006)
