العنوان بلغة أخرى: |
دراسة عن مقدرة العلامات الوراثية (Microsatellite) في دراسة التقييم الجيني لجراد البحر الشوكي الصدفي (Panulirus Homarus) في محافظة الشرقية وتطبيقها في إدارة مصائد الأسماك |
---|---|
المؤلف الرئيسي: | Al-Barashdi, Huda Khalfan (Author) |
مؤلفين آخرين: | Delghandi, Madjid (Advisor) |
التاريخ الميلادي: |
2017
|
موقع: | مسقط |
الصفحات: | 1 - 74 |
رقم MD: | 972969 |
نوع المحتوى: | رسائل جامعية |
اللغة: | الإنجليزية |
الدرجة العلمية: | رسالة ماجستير |
الجامعة: | جامعة السلطان قابوس |
الكلية: | كلية العلوم الزراعية والبحرية |
الدولة: | عمان |
قواعد المعلومات: | Dissertations |
مواضيع: | |
رابط المحتوى: |
المستخلص: |
عنوان البحث: دراسة عن مقدرة العلامات الوراثية (Microsatellite) في دراسة التقييم الجيني لجراد البحر الشوكي الصدفي (panulirus homarus) في محافظة الشرقية وتطبيقها في إدارة مصائد الأسماك. التقييم الوراثي للكائنات البحرية مثل جراد البحر الشوكي مهم في تحديد المخزونات لإدارة مصايد الأسماك. تنتشر يرقات الكائنات البحرية على مسافات بعيدة مما يجعل المخزونات مختلطة وتكون إدارة مصائد الأسماك صعبة دون تحديد دقيق للمخزونات. لقد لوحظ انخفاض في مصائد جراد البحر الشوكي في عمان ودراسة التنوع الجيني لهذا النوع سيساعد في إدارة مصائد هذا النوع. في هذه الدراسة تم دراسة التركيب الوراثي لجراد البحر الشوكي (p. homarus) من محافظة الشرقية باستخدام تسعة وأربعين علامة وراثية تم تحديدها سابقا. تم جمع عشرين عينة من منطقة الأشخرة وثلاثين عينة من منطقة مصيره من محافظة الشرقية لجراد البحر الشوكي لهذه الدراسة. تم استخلاص الحامض النووي الجيني (DNA) لهذه العينات باستخدام طريقة (CTAB). تم إجراء تفاعل البلمرة المتسلسلة (Polymerase Chain Reaction) باستخدام العلامات الوراثية التي جمعت في أربعة عشرة مجموعة (multiplexes). تم التحليل الوراثي (Fragment Analysis) للعينات باستخدام جهاز (3130 capillary sequencer)، ومن ثم تم استخدام برنامج GeneMapper للحصول على البيانات. اعتمادا على البيانات المحصلة من برنامج (GeneMapper) للعلامات الوراثية (Microsatellites). لقد تم حساب التنوع الوراثي (Genetic Diversity) ودراسة هيكلة (Structuring) جراد البحر الشوكي (p. homarus) باستخدام عدد من البرامج. تعتبر العلامات الوراثية (microsatellites) المستخدمة متنوعة جينيا (polymorphic) اعتمادا على نتائج متوسط عدد الأليلات الكلي (6.65)، متوسط الثراء الأليلي (allelic r 6.44 richness) ومتوسط (PIC=0.505). وجد أن متوسط التغاير الوراثي (Heterozygosity) المتوقعة والمشاهدة عبر كل مواضع العلامات الوراثية (Microsatellite loci) لجميع العينات هو 0.543 و0.372 على التوالي. لقد لوحظ الانحراف عن اتزان هاردي وينبرج (deviation from Hardy Weinberg Equilibrium) في أربعة عشرة علامة وراثية لجميع العينات للمنطقتين المدروستين (p<0.001)، ولقد لوحظ أن هناك خلل في الترابط بصورة كبيرة (Significant linkage disequilibrium) في 5 أزواج من المواضع (loci) من أصل 1176 زوج (p<0.001) للمنطقتين المدروستين. لقد لوحظ أن جراد البحر الشوكي المدروس من المنطقتين تمتلك مؤشرات جينية متشابهة (Genetic Diversity indices). وأيضا كشفت نتائج اختبار (AMOVA) أن نسبة الاختلاف بين جراد البحر الشوكي من المنطقتين هي 1% فقط. بالإضافة إلى نتيجة معامل التميز الجيني (FST=0.009) ونتيجة متوسط معدل تدفق الجينات بين المنطقتين (NM=2.946) والآتي أظهرن أن هناك اختلاط بين جراد البحر الشوكي من المنطقتين. عدم وجود هيكلة واضحة لجراد البحر الشوكي من كلا المنطقتين تم ملاحظته أيضا باستخدام البرامج التالية: (STRUCTURE v.2.3.4)، شجرة النشوء والتطور (phylogenetic tree) باستخدام برنامج (mega 7)، وباستخدام حزم برنامج (R Studio) التالية (adegenet, netveiw)، وحزمة (divMigrate) لبناء شبكة الهجرة النسبية (relative migration network)، ونستنتج من هذه الدراسة أن ليس هناك هيكلة واضحة لجراد البحر الشوكي من المنطقتين المدروستين وبالتالي فإن نفس إدارة المصائد المتبعة في منطقة الأشخرة يمكن تطبيقها للجراد البحر الشوكي في منطقة مصيره. |
---|