Molecular Characterizations of Integrons in Clinical Isolates of Klebsiella Pneumoniae by Whole Genome Sequencing in a Tertiary Care Hospital in Oman
| العنوان بلغة أخرى: |
التوصيف الجزيئي للإنتجرونات في العزلات السريرية لبكتيريا الكلبسيلة الرئوية بواسطة التسلسل الجينومي الكامل في مستشفى للرعاية بعد الثانوية في عمان |
|---|---|
| المؤلف الرئيسي: | Al Muzahmi, Muna Nasser Khalfan (Author) |
| مؤلفين آخرين: | Al Jabri, Zaaima (Advisor) , Rizvi, Meher (Advisor) |
| التاريخ الميلادي: |
2020
|
| موقع: | مسقط |
| الصفحات: | 1 - 79 |
| رقم MD: | 1191531 |
| نوع المحتوى: | رسائل جامعية |
| اللغة: | الإنجليزية |
| الدرجة العلمية: | رسالة ماجستير |
| الجامعة: | جامعة السلطان قابوس |
| الكلية: | كلية الطب والعلوم الصحية |
| الدولة: | عمان |
| قواعد المعلومات: | Dissertations |
| مواضيع: | |
| رابط المحتوى: |
عدد مرات التحميل
13
| المستخلص: |
نظرة عامة: الإنتجرونات هي عناصر شبه متحركة لها دور كبير في نشر الجينات التي تمنح المقاومة للمضادات الحيوية بين البكتيريا تهدف هذه الدراسة إلى وصف مدى انتشار وتوصيف السمات الجزيئية للإنتجرونات في العزلات السريرية للالتهاب الرئوي. الطريقة: تم فحص ما مجموعة 50 عزلة تمثيلية لبكتيريا الكلبسيلة الرئوية ذات المقاومة لمجموعة متعددة من المضادات الحيوية من مستشفى السلطان قابوس الجامعي (SQUH) لدراسة وجود ثلاث أنواع من الانتجرونات (١-٣) بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR). تم إجراء اختبار الحساسية لمضادات الميكروبات بطريقة disc diffusion وفقا لإرشادات معهد المعايير السريرية والمخبرية (CLSI). تم تضخيم المناطق المتغيرة وتنفيذ التسلسل الجينومي الكامل للكشف عن أشرطة الجينات. تم إجراء تجربة الإقتران لتقييم قابلية الأشرطة الجينية على الانتقال الأفقي بين البكتيريا تم إجراء التسلسل الجينومي الكامل (WGS) لعزلات تمثيلية يبلغ عددها ٢٣، وتحليلها باستخدام أدوات معلوماتية حيوية مختلفة وذلك لتحديد نوع التسلسل (ST)، وجينات المقاومة المكتسبة المضادة للميكروبات، وتحديد أنواع البلازميد للسلالات الحاملة للإنتجرون. تم تحديد الأنماط المصلية الخبيثة للغاية من خلال تضخيم خمسة جينات من النمط المصلي الكبسولي لعينات البكتيريا الكلبسيلة الرئوية من العزلات الموجبة للاندروجين. النتائج: تم تحديد النوع الأول من الانتجرونات بنسبة تبلغ ٩٦% من مجموع العينات، بينما لم يتم الكشف عن النوع الثاني والثالث في أي من العينات. من بين العزلات الموجبة للإنتجرون، ١٨ عزلة تحتوي على المناطق المتغيرة التي تحمل الأشرطة الجينية. جميع العينات التمثيلية التي اختبرت للانتقال الأفقي، اثبتت نجاح انتقال الانتجرونات بين الخلايا كما أثبت التسلسل الجينومي الكامل وجود هذه الانتجرونات على بلازميدات مقترنة تم الكشف عن عشرة أصناف مختلفة من أشرطة الجينات مع وجود (dfrA14) كأكثر أشرطة الجينات انتشارا بنسبة (34.8%) في أوساط النوع الأول من الانتجرونات. علاوة على ذلك، كشف تحليل MLST عن تسعة أنواع تسلسلية (ST)، مع وجود نوعي ST-231 وST-395 كأكثر الأنواع سيادة. كان كل من blaOXA-232 وblaCTX-M-15 أكثر أنواع الكاربابينيم (carbapenems) وبيتا لاكتاميز (beta-lactamases) في العزلات المتسلسلة ثلاث عزلات فقط صنفت كأنماط مصلية شديدة الخبث من النوعين (K1) و(K2). الخلاصة: أبرزت هذه الدراسة انتشارا واسعا للنوع الأول من الانتجرونات بين عزلات البكتيريا الكلبسيلة الرئوية ذات المقاومة لمجموعة متعددة من المضادات الحيوية كما أكدت انتشار جينات المقاومة المضادة للميكروبات عن طريق النقل الأفقي. لذلك، فإن الاستخدام الحكيم للمضادات الحيوية والتقيد بالتدابير الفعالة لمكافحة العدوى أمر ضروري للحد من زيادة نشر الكائنات المقاومة للعديد من المضادات الحيوية. |
|---|
عناصر مشابهة
-
A Whole Genome Sequencing Study of Predominant Capsular Serotypes in Multidrug-Resistant Hypervirulent Klebsiella Pneumoniae Clinical Isolates in Oman
بواسطة: Al Busaidi, Basaier Nooh Mohammed منشور: (2022) -
Detection and Characterization of Extended Spectrum B-Lactamase Enzymes in Clinical Isolates of Escherichia Coli and Klebsiella Pneumoniae at Sultan Qaboos University Hospital SQUH
بواسطة: Al-Zadjali, Asia Hassan منشور: (2013) -
Detection and Characterization of Metallo-B-lactamases in Clinical Isolates of Pseudomonas aeruginosa, Escherichia Coli and Klebsiella Spp. Collected from Sultan Qaboos University Hospital (SQUH)
بواسطة: Al-Bimani, Atika Ali منشور: (2011) -
Molecular Analysis of Carbapenem Resistance among Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae in Hilla Hospitals
بواسطة: عباس، فاطمة معين منشور: (2013) -
Characterization of Acinetobacter Baumannii Clinical Isolates and in Vitro Analysis of Antibiotic Combinations Therapy
بواسطة: Al-Damen, Sara Thogan Talal منشور: (2021)
