| LEADER |
03235nam a22003617a 4500 |
| 001 |
1482199 |
| 041 |
|
|
|a eng
|
| 100 |
|
|
|9 466097
|a Siam, Reema Mazen
|e Author
|
| 245 |
|
|
|a Using Molecular Modeling to Identify Zinc Finger Protein-DNA Recognition Patterns:
|b A Study of Four Finger Proteins and Dimer Binding to DNA
|
| 246 |
|
|
|a استخدام التمثيل الجزيئي لتحديد أنماط تعرف بروتين أصبع الزنك على الحمض النووي:
|b دراسة ارتباط أربعة أنماط من بروتين أصبع الزنك والبروتين الثنائي مع الحمض النووي
|
| 260 |
|
|
|a بيرزيت
|c 2017
|
| 300 |
|
|
|a 1 - 131
|
| 336 |
|
|
|a رسائل جامعية
|
| 502 |
|
|
|b رسالة ماجستير
|c جامعة بيرزيت
|f كلية الدراسات العليا
|g فلسطين
|o 1177
|
| 520 |
|
|
|a عملية ارتباط بروتينات أصبع الزنك مع الحمض النووي تعد من العمليات الهامة لتنظيم العديد من العمليات البيولوجية. في هذه الدراسة، تم استخدام حسابات التمثيل الجزيئي لحساب طاقة الربط لأربعة أنماط من أصبع الزنك والبروتين الثنائي للحصول على المركبات في حالة الاتزان ولاستخراج الروابط المهمة التي تحدد الخصوصية لبروتينات أصبع الزنك المرتبطة مع الحمض النووي. علاوة على ذلك، طاقة الربط لبروتينات أصبع الزنك مع الحمض النووي تم حسابها باستخدام طريقة (Molecular Mechanics Poission Boltzman (Generalized born) Surface Area) على وجه الخصوص، بروتين أصبع الزنك المتعدد (PRDM9A, PDB ID:5EGB) ومتغيراته (L9/24, L13, L20 bind CA, and L20 bind CG) قيم طاقة الربط الناتجة هي (-29.48, -31.92, -27.83, -22.44, and -9.97 kcal/mol) بينما قيم طاقة الربط للبروتينات الثنائية PPR1 (PDB ID: 1PYI) and PUT3 (PDB ID: 1ZME) مع الحمض النووي هي (-7.35, -15.79 kcal/mol) أظهرت طاقات الربط المذكورة ارتباطا ضعيفا مع الطاقات التي تم الحصول عليها تجريبياR = 0.69) ل MM/PBSA و R = 0.59 ل (MM/GBSA.
|
| 653 |
|
|
|a الحمض النووي
|
| 653 |
|
|
|a التمثيل الجزيئي
|
| 653 |
|
|
|a أصبع الزنك
|
| 653 |
|
|
|a التحاليل الطبية
|
| 700 |
|
|
|9 32611
|a Hamed, Mazen Y.
|e Advisor
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-T.pdf
|y صفحة العنوان
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-A.pdf
|y المستخلص
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-C.pdf
|y قائمة المحتويات
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-F.pdf
|y 24 صفحة الأولى
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-1.pdf
|y 1 الفصل
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-2.pdf
|y 2 الفصل
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-3.pdf
|y 3 الفصل
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-O.pdf
|y الخاتمة
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-R.pdf
|y المصادر والمراجع
|
| 856 |
|
|
|u 9808-013-001-1177-S.pdf
|y الملاحق
|
| 930 |
|
|
|d y
|
| 995 |
|
|
|a Dissertations
|
| 999 |
|
|
|c 865136
|d 865136
|
