Type I Interferon Related Genes and Systemic Lupus Erythematosus "SLE": Identification of Regulatory Variations Potentially Associated with Disease Immunopathogenesis
| العنوان بلغة أخرى: |
الجينات المرتبطة بالإنترفيرون النوع الأول والذئبة الحمامية الجهازية "س ل ي": تحديد الاختلافات التنظيمية المحتملة المرتبطة بالمرض |
|---|---|
| المؤلف الرئيسي: | المطاعني، لوزة بنت جميع بن ناصر (مؤلف) |
| مؤلفين آخرين: | Hassan, Batool (Advisor), Alansari, Aliya Saleh (Advisor) |
| التاريخ الميلادي: |
2017
|
| موقع: | مسقط |
| الصفحات: | 1 - 93 |
| رقم MD: | 948428 |
| نوع المحتوى: | رسائل جامعية |
| اللغة: | الإنجليزية |
| الدرجة العلمية: | رسالة ماجستير |
| الجامعة: | جامعة السلطان قابوس |
| الكلية: | كلية العلوم |
| الدولة: | عمان |
| قواعد المعلومات: | Dissertations |
| مواضيع: | |
| رابط المحتوى: |
عدد مرات التحميل
77
| المستخلص: |
الذئبة الحمامية الجهازية (سلي) هو مرض المناعة الذاتية متعدد الأجهزة مع مجموعة واسعة من المظاهر السريرية. بما في ذلك تقريبا جميع الأنسجة والأعضاء. في عمان، وانتشاره في الطفولة المبكرة هو 29.68 لكل 100.000. وعلاوة على ذلك، فإن معدل المرض في عمان أعلى (36%) مقارنة مع العالم الغربي (10-12%) إن مسار IFN من النوع الأول هو توقيع المرض المرضي. أيضاً، فإن الخلل في نسبة TH17 وTreg يعتبر أن تلعب دوراً هاماً في المرضية. مسببات المرض لا تزال مجهولة. وقدرت نسبة التوريث بحوالي 43.9%، في حين تقدر حصة العوامل البيئية والعوامل البيئية غير المشتركة بنسبة 25.8% و30.3% على التوالي. ومع ذلك، يمكن للتغيرات الوراثية المحددة تفسر 15٪ فقط من التوريث وترك حوالي 85% غير محدد. ويمكن أن يعزى لفقدان الوراثة إلى اختلافات جينية يمكن أن تعمل كوسطاء بين القابلية الوراثية والمحفزات البيئية. وكان الهدف من الدراسة دمج البيانات الحسابية والتجريبية لتحديد الاختلافات التنظيمية المرشحة لسلي، والتي ترتبط مع الجينات ذات الصلة لنوع I مسار IFN وخلق فرضية التي تربطهم المرض المرضية المناعية. تم تحديد جينات IFN من النوع الأول استناداً إلى كتالوج GWAS واستخدمت STRING لإظهار العلاقات القائمة على التفاعلات المعروفة والمتوقعة. ثم، تم جمع الاختلافات الشائعة ≤) 5%) في الجينات المحددة من dbSNP وتمت تصفيتها على أساس التنبؤ الوظيفي باستخدام FuncPred. تم فحص تأثير الاختلافات على التعبير الجيني التفاضلي في الأجهزة المناعية باستخدام Gtex. تم استخدام 3DSNP لتحديد ملامح الجينات المرتبطة بالاختلافات. تم فحص الاختلافات التنظيمية المحتملة التي تغير التعبير الجيني بشكل كبير من أجل تعيين الاختلافات الجينية في TH17 أو Treg استنادا إلى مشاريع ENCODE وRoadmap. وقد وجدت الدراسة 11 اختلافات مرتبطة الذئبة الحمراء، وكان 15 اختلاف مرتبطة GWAS و38 اختلاف وظيفي جديد محتمل. والجدير بالذكر أن معظم الاختلافات التفاضلية التي تم تحديدها H3k4me1) و H3k4me3 و (H3k27ac كانت في TH17 (98.5%) وحيث ترتبط مع الوضع الجيني النشط. نحن نعتقد أن نتائجنا تدعم الفرضية القائلة بأن مسار IFN من النوع الأول و Th17, يعملان معا في اليه مرض للذئبة الحمراء، وبالتالي الاختلافات الوظيفية المرتبطة بها يجب أن تكون ذات أولوية في التحقيقات الجينية. في الختام، قدمت هذه الدراسة أدلة وظيفية إضافية لمخاطر الاختلافات المنشورة وخطر حدوث مرض الذئبة الحمراء، ورشحت أيضاً قائمة من الاختلافات المحتملة الجديدة لدراسات جينية المستقبلية. وعلاوة على ذلك، أمكن إيجاد فرضية تمكن من تفسير ارتباط الاختلافات المرضية في المرض والمتعلقة بمسار تغيير IFN والأخلال في نسبة Treg /TH17. وتوصي الدراسة بأن باستخدام تلك الاختلافات لدراسات مراقبة الحالة في المستقبل على مرضى الذئبة الحمراء. |
|---|
عناصر مشابهة
-
Systemic Lupus Erythematosus Presenting with Psychosis
بواسطة: Abu Hijleh, Nizam منشور: (1997) -
Type I Ifn-Module Genes in Systemic Lupus Erythematosus
بواسطة: Al Moqbali, Aliaa Salem منشور: (2021) -
Significance of Lupus Band Test in Libyan Patients with Systemic Lupus Erythematosus
بواسطة: Elghriani, Abdelbasit M. M. منشور: (2014) -
Steroid induced Diabetes Mellitus among Systemic Lupus Erythematosus patients in rheumatologic Clinics at Khartoum State
بواسطة: Satti, Samar Altahir Abdelkareem منشور: (2018) -
Machine Learning for Identifying Severity Clusters in Omani Patients with Systemic Lupus Erythematosus
بواسطة: الصوافي، سمية بنت خليفة بن عامر منشور: (2021)
