المصدر: | مجلة جامعة البيضاء |
---|---|
الناشر: | جامعة البيضاء |
المؤلف الرئيسي: | Sultan, Mujeeb A (Author) |
المجلد/العدد: | مج1, ع2 |
محكمة: | نعم |
الدولة: |
اليمن |
التاريخ الميلادي: |
2019
|
الشهر: | ديسمبر |
الصفحات: | 241 - 248 |
ISSN: |
2709-9695 |
رقم MD: | 1316721 |
نوع المحتوى: | بحوث ومقالات |
اللغة: | الإنجليزية |
قواعد المعلومات: | EduSearch, HumanIndex |
مواضيع: | |
كلمات المؤلف المفتاحية: |
Molecular Docking | Lipophilicity | Binding Affinity | Antidepressants | Tetracyclic
|
رابط المحتوى: |
المستخلص: |
لتوضيح الأساس الجزيئي لمركبات مكلورة رباعية الحلقات كمضادات الاكتئاب، تم إجراء الدراسات الحاسوبية لها. حيث تم دراسة الالتحام الجزيئي لها باستخدام برنامج Molegro Virtual Docker؛ تم تنزيل البنية البلورية ثلاثية الأبعاد لنماذج البروتينات ذات العلاقة من قاعدة بيانات بنك البروتينات (PDB ID: 2A65; l 2QJU) PDB تم تحميل المركبات المراد دراستها ونماذج البروتين على برنامج Molegro Virtual Docker ليتم حساب قابلية الارتباط بين المركبات ونماذج البروتينات كدالة MolDock. أظهرت هذه الحسابات التوافق بين قابلية الارتباط كدالات MolDock ودرجة الإستشحام المحسوبة نظرياClog P ، كما أظهرت نتائج الالتحام لجميع المركبات تحت الدراسة 1-10 وكذا للمرجع الدوائي المابروتيلين 11 أن هناك تداخلات ذات أهمية مع مواقع الربط لنماذج البروتنات المستخدمة. ولذا فإن الإستشحام يبدو تلعب دورا حاسما في هذه التداخلات كما يبدو. To clarify the molecular basis of the chlorinated tetracyclic as antidepressant agents, computational studies were carried out. Molecular docking was carried out using Molegro Virtual Docker program; the 3D crystal structure of the recruited models were downloaded from PDB database (PDB ID: 2A65; l 2QJU). The optimized compounds and protein models were loaded to Molegro Virtual Docker program and the binding affinity as MolDock score function was calculated. The MolDock scores are in consistency with the theoretically calculated lipophilicity Clog P, The docking results of the all compounds 1-10 and reference drug maprotiline 11 showed significant interactions with binding site of the recruited models. Lipophilicity appears to play crucial role in these interactions. |
---|---|
ISSN: |
2709-9695 |