ارسل ملاحظاتك

ارسل ملاحظاتك لنا







Kinase Inhibitors as Potential Drugs : A Molecular Dynamics Simulation Study

المؤلف الرئيسي: Hammad, Iman (Author)
مؤلفين آخرين: Hamed, Mazen Y. (Advisor)
التاريخ الميلادي: 2017
موقع: بيرزيت
الصفحات: 1 - 137
رقم MD: 865153
نوع المحتوى: رسائل جامعية
اللغة: الإنجليزية
الدرجة العلمية: رسالة ماجستير
الجامعة: جامعة بيرزيت
الكلية: كلية الدراسات العليا
الدولة: فلسطين
قواعد المعلومات: Dissertations
مواضيع:
رابط المحتوى:
صورة الغلاف QR قانون

عدد مرات التحميل

9

حفظ في:
LEADER 04249nam a22003377a 4500
001 1482205
041 |a eng 
100 |9 466107  |a Hammad, Iman  |e Author 
245 |a Kinase Inhibitors as Potential Drugs :  |b A Molecular Dynamics Simulation Study 
260 |a بيرزيت  |c 2017 
300 |a 1 - 137 
336 |a رسائل جامعية 
502 |b رسالة ماجستير  |c جامعة بيرزيت  |f كلية الدراسات العليا  |g فلسطين  |o 1180 
520 |a في هذه الدراسة قمنا باستخدام التمثيل الجزيئي من أجل حساب قيم طاقة الربط لخمس مثبطات لإنزيم الكاينيز PDK 1-باستخدام الطريقتين (Molecular Mechanics/ Generlized-Born surface area) (Molecular Mechanics/ Poisson Boltzmann surface area). وتم حساب قيم مساهمة الفوضى T.ΔS باستخدام طريقة (Nmode) وتم حساب التغير في الطاقة HΔ باستخدام هذه المعادلة ΔG = ΔH – T.ΔS. هناك فرق ملحوظ في قيم التغير في طاقة الربط اعتمادا على طريقة الحساب سواء باستخدام (MM-PBSA or MM-GBSA) بحيث كانت نتائجMM-GBSA أفضل من نتائج MM-PBSA وهذا يرجع إلى الاختلاف في طريقة الحساب التي يتم اعتمداها من قبل MM-PBSA and MM-GBSA. كذلك وضحت نتائج هذه الدراسة كيفية ارتباط هذه المثبطات بإنزيم الكاينيز PDK-1والتي يمكن استخدامها لعلاج السرطان، بحيث أن موقع جزيئات الماء كانت موجودة في مواقع الربط ويمكن استخدام هذه النتائج في تصميم مثبطات أفضل من خلال إضافة ذرات مثل الأوكسجين والهيدروجين للمثبط لكي يكون قادرا على تكوين روابط هيدروجينية لكي يحل مكان جزيئات الماء التي كانت موجودة في مواقع الربط من خلال الاستناد على مبدأ تكوين مثبطات جديدة محاكية لجزيئات الماء. من خلال محاكاة الديناميات الجزيئية قمنا بتحديد مثبط (المركب 5) والذي يرتبط بشكل فريد بأنزيم الكاينيز PDK-1 لتكوين كاينيز غير نشيط على نقيض المركبات الأخرى (4-1) والتي يتم اعتبارها مثبطات كاينيز كلاسيكية منافسة ل.ATP ومن الجدير بالذكر أن المثبط (المركب 5) هو دواء فعال وذلك بسبب قيمة طاقة الربط الكبيرة ΔG = -52.3 Kcal/mol، هذه القيمة الكبيرة ناتجة من تكوين خمس روابط هيدروجينية قوية بين هذا المثبط وأنزيم الكاينيز PDK-1. وفقا لما ذكرته التقارير فإن النوع الأول من مثبطات الكاينيز (مثبطات كلاسيكية منافسة لATP) تتميز عن النوع الثاني من المثبطات من خلال تشكيل شبكات من الروابط الهيدروجينية بواسطة جزيئين من الماء وهذا يتوافق مع نتائج هذه الدراسة بحيث أنه تم ملاحظة هذه الميزة في المثبطات (المركب4) و(المركب 3). 
653 |a الأدوية 
653 |a انزيم الكاينيز 
653 |a التمثيل الجزيئي 
700 |9 32611  |a Hamed, Mazen Y.  |e Advisor 
856 |u 9808-013-001-1180-T.pdf  |y صفحة العنوان 
856 |u 9808-013-001-1180-A.pdf  |y المستخلص 
856 |u 9808-013-001-1180-C.pdf  |y قائمة المحتويات 
856 |u 9808-013-001-1180-F.pdf  |y 24 صفحة الأولى 
856 |u 9808-013-001-1180-1.pdf  |y 1 الفصل 
856 |u 9808-013-001-1180-2.pdf  |y 2 الفصل 
856 |u 9808-013-001-1180-3.pdf  |y 3 الفصل 
856 |u 9808-013-001-1180-O.pdf  |y الخاتمة 
856 |u 9808-013-001-1180-R.pdf  |y المصادر والمراجع 
856 |u 9808-013-001-1180-S.pdf  |y الملاحق 
930 |d y 
995 |a Dissertations 
999 |c 865153  |d 865153